Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms