Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb2O55029 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb2O55029 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms