Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms