Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole2O54956 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms