Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2f6O54917 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms