Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DffaO54786 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DffaO54786 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DffaO54786 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DffaO54786 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms