Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limk2O54785 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limk2O54785 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms