Protein–RNA interactions for Protein: O54692

Zw10, Centromere/kinetochore protein zw10 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zw10O54692 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zw10O54692 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms