Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms