Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sp100O35892 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sp100O35892 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms