Protein–RNA interactions for Protein: O35885

Ascl2, Achaete-scute homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl2O35885 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl2O35885 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms