Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfibp2O35711 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppfibp2O35711 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms