Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Opn1mwO35599 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Opn1mwO35599 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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