Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms