Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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