Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf5O35445 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf5O35445 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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