Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc1O35379 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc1O35379 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
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