Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms