Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hs3st1O35310 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hs3st1O35310 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms