Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptpn9O35239 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ptpn9O35239 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ptpn9O35239 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn9O35239 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ptpn9O35239 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms