Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms