Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1aO35134 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms