Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3cO35066 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms