Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Cldn4O35054 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Cldn4O35054 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms