Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms