Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClockO08785 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClockO08785 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClockO08785 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClockO08785 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClockO08785 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClockO08785 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClockO08785 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClockO08785 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClockO08785 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms