Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MttpO08601 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MttpO08601 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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MttpO08601 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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MttpO08601 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MttpO08601 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MttpO08601 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MttpO08601 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MttpO08601 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms