Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms