Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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MsmbO08540 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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