Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm20878L7N244 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm20878L7N244 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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