Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IfnabL7MTU6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms