Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3542K7N6U2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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