Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm379J3QQ19 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm379J3QQ19 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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