Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer2J3QPU5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms