Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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