Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm21900J3QP38 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm21900J3QP38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm21900J3QP38 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm21900J3QP38 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21900J3QP38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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