Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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