Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm17577J3QNF7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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