Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms