Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
7530416G11RikJ3QJX6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms