Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms