Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc9a3G3X939 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a3G3X939 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms