Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r76F8VQ63 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms