Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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