Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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