Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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