Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms