Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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