Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod3E9QA62 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms