Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms